Авторами рассмотрен один из возможных подходов к оптимальному управлению процессом перевода автотранспортного предприятия на альтернативное топливо. Предложены математическая модель дискретного стохастического программирования и алгоритм ее решения на основе имитационного моделирования. Построена стратегия перевода на альтернативный вид топлива автотранспортного предприятий Оренбургской области с использованием разработанного программного средства.